Le nom de la ville est étroitement lié à des entreprises de renommée internationale,

Carl Zeiss Jena GmbH, mondialement connu pour la fabrication des meilleurs objectifs caméra du monde, également utilisés dans des observatoires, des lentilles de précision, etc ;

Jenoptik AG qui travaille dans le domaine de la laser-technologie, de la micro-optique et de l’utilisation de la lumière comme outil de pilotage ou de mesure ;

Schott Jenaer Glas GmbH, connue pour ses plaques céramiques, ses fibres optiques, ses panneaux solaires ;

Jenapharm GmbH & Co. KG, qui travaille au développement de nouveaux médicaments